受教育程度(EA)受认知能力以外的特征影响，但我们对这些“非认知”对EA贡献的遗传结构知之甚少。在这里，我们使用基因组结构方程模型和先前的EA (N = 1,131,881)和认知测试表现(N = 257,841)的全基因组关联研究(GWASs)来估计独立于认知能力的SNP与EA变异的关联。我们确定了157个全基因组显著位点和一个多基因结构，占EA遗传方差的57%。非认知遗传与社会经济成功和长寿的关系与与认知表现相关的遗传变异一样密切。非认知遗传学进一步与对经验和其他人格特征的开放性、风险较小的行为以及精神障碍的风险增加有关。非认知基因在与认知能力相同的脑组织和细胞类型中得到丰富，但与脑灰质容量有不同的关联。通过对未直接测量的表型进行GWAS，我们提供了影响教育成功的非认知技能遗传结构的第一个观点。